El principal objetivo del comité fitosanitario es asesorar precisamente en las materias fitosanitarias y dar respuesta a las consultas que la industria semillera mundial realiza a Anpros respecto de las regulaciones de Chile y sus temas relacionados.
Su origen proviene principalmente de asociaciones semilleras internacionales como la ISF (International Seed Federation) y asociaciones regionales como la SAA (Seed Association of the Americas).